Impact ipf Datei funktioniert nicht richtig

SO hier nun auch schon mein 2tes problem mit Impact. Seit der Version 7
ist es ja zum glück möglich eine Datei für die einstellungen im
"File-Mode" und im " configuration-Mode" zu erstelen. Nur leider
funktioniert das bei mir nicht so ganz.
Zunächst gebe ich ja meinen Flashtyp, meine zieldatei (untitled.mcs)
etc ein. Anschliessend wechselt man in den configurationsmodus, um dort
den Spartan-2 und das Flash zu finden. Dem Flash weise ich auch dann
meine mcs Datei zu und programmiere. Dieser verlauf wird doch meines
wissens nach in der ipf Datei gespeichert. So nun habe ich aber das
problem das ich beim verwenden der ipf datei auch zu dem Punkt gelange
an dem ich nur noch auf programmieren drücken muss, aber er
aktualisiert nie die mcs Datei mit den änderungen die ich im Programm
vorgenommen habe.
Compiliert wurde der neue Programmcode auch, das bitfile ist auch
aktualisiert, aber leider ist die mcs Datei auf dem alten Stand.
Ich hoffe man kann meine eErklärung verstehen und ich habe mich nicht
zu  schlecht ausgedrückt.
Ist das ein Bug in der Software, oder bin ich der Bug?