Merkwürdiges Einschaltverhalten verursacht durch externe Last?

Hallo Leute,
Ich hab auf meinem Board einen Attiny 44A der (später mal) über i2c 
Daten empfangen soll und daraus die PWM für 8 KSQ berechnet. In dem Bild 
ist zu sehen wie die KSQ mit dem Mikrocontroller verbunden sind.

Die KSQ basieren auf dem IC MC 34063A. Laut Datenblatt werkelt da drin 
ein Komparator der die PWM ermöglicht. Da am Eingang des Komparators 
näherungsweise kein Strom fließt haben wir uns mit 1MOhm für einen 
relativ großen Widerstand zwischen dem Mikrocontroller-Pin und dem PWM 
Eingang entschieden. Das funktioniert auch tadellos. Das soll dem Schutz 
des Mikrocontrollers dienen. zusätzlich hängt noch ein 10K-Pullup dran 
um den PWM-Kanal beim Einschalten auf einem definierten Zustand zu 
haben.

Spannungsversorgung des Mikrocontrollers erfolgt über Flachbandkabel 
gepuffert mit einem 10µF Kerko von einem Hauptboard das einen Trafo 
beherbergt.

Die KSQ bekommen 24V Versorgung von einem Schaltnetzteil.

Das Problem ist nun, dass der Mikrocontroller beim Einschalten (sprich 
Stecker in die Dose stecken. Schaltnetzteil und Trafo auf dem Hauptboard 
werden dabei gleichzeitig eingeschaltet) nur Blödsinn von sich gibt.

zwischendurch merke ich dann, dass er doch irgendwie Codeschnipsel 
abarbeitet, da ich bekannte Muster am Ausgang erkenne. Ich vermute das 
er zufällig im Code umherspringt. Doch warum tut er das? Er arbeitet nur 
korrekt nachdem ich ihn geflasht habe.

Manchmal hilft es wenn ich erst den Traf einstecke sodass der 
Mikrocontroller versorgt wird und später das SNT einschalte. Aber eben 
nicht immer. Und das ganze soll wenn es fertig ist ja auch nicht "ab und 
zu" funktionieren :/

Vielleicht sieht ein pfiffiger Kopf ja hier sofort was los ist und kann 
mir auf die Sprünge helfen. Wenn ich irgendwelche Infos vergessen habe 
bitte sagen ...

MfG Mirco