Board to Board Verbindung

Hallo zusammen. Ich würde gerne mal Erfahrung bezüglich Board zu Board 
Verbindungen hören. Was ich generell vorhabe, ist eine digitale Basis 
platine, die sich mit CPU und FPGA um die Steuerung eines darauf 
liegenes Moduls kümmert, wo hauptsächlich Analoges drauf ist. Diese wird 
mit Abstandshalter darauf befestigt.

Jetzt will ich natürlich die ADCs per SPI auslesen also muss neben 
Spannungsversorgung auch ca 20Mhz dahin. Ich hatte erst daran gedacht 
PC104 Stecker dafür zu benutzen aber die haben einen doch recht großen 
Abstand und nehmen viel Platz weg. Außerdem würde ich viele Pins nur mit 
GND belegen um möglichst EMI arm zu sein. Da dachte ich an FPC Kabel. 
Dort ist die ausbeute höher. Allerdings müssen auf dem Analogteil auch 
ca 800mA.

Was ist bei euch die präferierte Lösung um gestapelte Boards miteinander 
zu verbinden?