Wenn das alles NiMH-Einzelzellen oder NiCD-Einzelzellen sind, so bekommen diese Zellen einen dauerhaften Schaden, wenn sie unter 1V tiefentladen werden.
Solche Zellen haben anschließend zumeist eine geringere Kapazität, eine schnellere Selbstentladung, einen höheren Innenwiderstand und meist - das ist bei Kleinverbrauchern oftmals das Schlimmste - auch eine geringere Entladespannung (z.B. nur noch 1,1V statt 1,2V). Da helfen dann keine Tricks mehr (z.B. Cycle-Refresh-Ladeverfahren) - die Zellen haben einfach einen dauerhaften Schaden.
Oftmals sind nur wenige Zellen in einem Akkupack betroffen - die kann man dann ggf. einzeln tauschen (wenn ein möglicherweise verbautes BMS, das Batteriemanagementsystem, nicht anschließend den Dienst verweigert - das machen die gern, wenn sie eine Spannungsunterbrechung feststellen).
Nach Deiner Beschreibung scheinen aber alle Deine Zellen länger unter 1V tiefentladen gewesen zu sein. Wenn das tatsächlich der Fall war, so hilft wirklich nur noch Entsorgen.
Sorry für diese schlechten Nachrichten.