Problem mit CodeWarrior!

Hallo allerseits,
ich benutze den CodeWarrior als IDE um einen MC68HC908JL16 zu 
programmieren. Das Teil besitzt zwei Timer. Ich habe nun versucht ein 
Programm zu erstellen, das beim Überschreiten eines jewissen Timerstands 
ein Interrupt auslöst. Ich wollte nun das Programm debugen, allerdings 
merkte ich, dass das Programm beim benützen von Timer2 im Debuger kein 
Interrupt auslöste und somit nicht funktionierte; als ich nun den 
Timer(eins) benützte funktionierte es einwandfrei. (Ich muss allerdings 
aufgrund der Hardware den Timer2 benützen.) Könnte es am Debuger liegen 
oder hat sonst jemand eine Ahnung was falschgelaufen sein könnte?