Unerklärliche Probleme mit Betriebssystem MQX - HELP!

Hallo miteinander,

ich muss im Rahmen meiner Diplomarbeit, für auf einem bereits 
vorhandenen DSP-Board ein Firmwareupdate durchführen. Verwendet wird auf 
dem DSP ein Betriebssystem von Precise MQX. Meine Änderungen betreffen 
lediglich den Algorithmus, sprich weit entfernt von irgendwelchen 
Speicherzugriffen, Task, Scheduling oder Sonstigem.

Mir scheint jedoch, dass bereits kleinste Änderungen in der Software 
unvorhersehbare Effekte auslösen, die dazu führen, dass das Board sich 
aufhängt? Der Algorithmus wird von 2 externen Messquellen 
Interrupt-gesteuert? Ich habe das Gefühl, dass sich die Interrupt in die 
Quere kommen?

Hat jemand von Euch, bereits ähnliche Erfahrungen gemacht?

Ich weiss meine Beschreibung, ist sehr allgemein gehalten? Ich bin aber 
für Berichte und Erfahrungen mit ähnlichem Hintergrund sehr dankbar.

Vielen Dank ung Gruß,
Max