at90can128 programmieren

moin!
ich habe ein c programm welches ich auf meinen AT90CAN128 der sich auf 
dem Entwicklungsboard ATDVK90CAN1 befindet schreiben möchte.
Programmiergerät hab ich das AVR MKii und als software avrstudio 4.14.

Aber ich finde nirgends anleitungen wie das nun genau abläuft. Das Ding 
hat ja  Flash und Eeprom speicher. auf welchen pack ich denn jetzt mein 
programm? und muss ich auf dem board nich irgendnen jumper zum 
programmieren setzen? wenn ich das programm aufgespielt habe, läuft das 
dan direkt los, oder erst nach nem neustart?
vielen dank für eure hilfe!!
tom