ATmega128: Software aufspielen per boot loader

Hallo.
Ich habe einen ATmega128, auf dem ein Boot Loader läuft.
Firmwareupdates können über die serielle Schnittstelle über ein
Download Utility aufgespielt weden. Diese Updates liegen dann in einem
HEX-Format vor.
Ich möchte gerne eigene Programme über diesen Boot Loader aufspielen.
Ich habe allerdings leider keine näheren Infos zu diesem Boot Loader.
Ist dies dann so ohne weiteres möglich?
Mein Compiler ist von Codevision. Kann ich das hier erzeugte HEX-File
verwenden oder muß ich beim Compilieren besondere Einstellungen
beachten?
Grüße Daniel