Pull up Quartus 2

Nun ja, Du klickst Dir im Assignment Editor ein entsprechendes 
Assignment zusammen. Erst mal oben die richtige Kategorie auswählen. 
Dann in FROM den Pin eintragen (oder Doppelkicken und auswählen). In der 
langen, langen Liste der möglichen Arten von Assignments den "Pull Up" 
auswählen und dieses Assignment dann auch noch auf Aktiv setzen. 
Abspeichern und fertig.

So wie es 
http://quartushelp.altera.com/9.1/mergedProjects/assign/ase/ase_intro.htm 
im Endeffekt auch beschreibt.