Signallänge mit Timer1-16Bit vermessen

Hallo, ich habe eine technische Schwierigkeit. Ich möchte mit Atmega48 4
Signallänge jeweils an 4-Pins(PD0-PD0) messen lassen. Bei Pegelwechsel
wird Interuppt  auslösen. Die Zeit wird mit 16-Bit-Timer1 ausgemessen. 
Den 16-Bit-Messwert ist in SRAM gespeichert, um später den Messwert auf 
LCD ausgeben.
 Zum Test wird PWM 1kHz (50/50) an PB0 gesendet. Aber ich kriege 
unsinnige Messwerte auf LCD. Ich vermute, dass  Zähler nicht auf Null 
sich setzt.
 Oder gibt es ein anderes Problem?

Cinfiguration Timer1:
ldi     temp1, ( 1 << CS10 )|( 1 << CS11
sts     TCCR1B, temp1

Cinfiguration PCINT(Pin change):
SETB PCICR,PCIE0,temp1;
ldi temp1,(1<<PCINT1)
sts PCMSK0,temp1
Interrupt:

 einspritz:push temp1
          push temp2

          lds temp1,TCNT1L
          lds temp2,TCNT1H

          STS timL,temp1
          STS timH,temp2
          ldi temp1,0
          sts TCNT1H,temp1
          sts TCNT1L,temp1

          pop temp2
          pop temp1
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