Controller kann Funktionen in anderen Files manchmal nicht aufrufen

Hallo, ich habe seit neuem ein komisches Problem.

Ich habe verschiedene C Files, in denen Funktionen deklariert sind. 
Diese Funktionen sind alle in einem inkludierten Headerfile definiert.

Im ersten File USART1 ist z.B. die Funktion void UART1 deklariert. In 
dieser Funktion finden unterschiedliche Routinen statt.

Im Simulator wird der PortC.5 2 mal ein und ausgeblinkt, jedoch auf der 
HW blinkt da gar nichts, außer ich schreibe UART1() in meinem Haupt C 
File am ende hinein.

Was könnte da die Ursache sein?

Ich habe zwar schon mal was von make all oder so gehört, jedoich dachte 
ich, dass AVR Studio das alles automatisch macht.

Was mache ich falsch?

liebe Grüße Anika