EEPROM per UART beschreiben - Beispiele

Hey Leute,

ich habe vieleicht eine Frage, die jeder schon tausend mal beantwortet 
hat, jedoch finde ich einfach keinen Beispiel so das ich es verstehe. 
Sorry im voraus. Mein Problem ist, dass ich einfach nicht verstehe wie 
das Zusammenspiel funktionieren soll.

Ich habe eine main routine wo mein ganzes Programm bisher ordentlich 
laeuft. Jetzt moechte ich die Moeglichkeit haben, einige festgelegte 
Werte aendern zu koennen, ohne dass ich uC neu flashen muss. So die 
Loesung dafuer ist ja EEPROM z.B. mit Hilfe von UART beschreiben und auf 
die Werte in EEPROM von main routine zugreifen. Aus EEPROM lesen klappt 
soweit so gut. Jedoch verstehe ich nicht wie ich per UART den EEPROM 
beschrieben soll! Muss mein Programm die main routine verlassen? Wenn ja 
muss ich das mit Reset machen und dann in ein Unterprogramm gehen oder 
muss dafuer komplet ein Bootloader geschrieben werden?

Ich programmiere mit Atmega128 in C. Hat vielleicht jemand einen schon 
programmierten Beispiel, wo sowas realisiert wurde?

Viele reden darueber, aber ich finde einfach keinen Beispiel.

Gruss und gute Nacht