Eclipse externe .c und .h files in existierendes Projekt einbinden (C/C++)

Guten Morgen,
Ich versuch grad von IAR Workbench auf Eclipse umzusteigen, ich habe 
dafür ein Makefile projekt erstellt, compilieren funktioniert. Tool zum 
fashen und debuggen sind eingebunden und funktionieren auch. Ich habe 
allerdings noch ein Problem, das die ganzen CMSIS files und Treiber 
Files des Herstellers in globalen Ordnern leigen (keine Unterordner des 
Projektordners), da sie für alle Projekte verwendet werden (sollen). Ich 
weis allerdings nicht wie ich diese Ordner richtig in das Projekt 
einbinde, damit man schön durch den Code und die Funktionen springen 
kann.
Ich habe verschiedene Varianten probiert, aber irgendwas schein ich 
falsch zu machen.
die header Files hab ich so eingebunden:
 rechtsklick aufs projekt -> Properties -> C/C++ General -> Paths and 
Symbols
dort im Reiter Includes alle Pfade per Add hinzugefügt (siehe 
Angehängtes Bild). Das scheint auch gut zu funktionieren.
Bei den c-Files hab so eingebunden:
rechtsklick aufs projekt -> New -> folder und dort die ordner der source 
files ausgewählt.

Eclipse Platform
Version: 3.4.2
Build id: M20090211-1700 (Ganymede)