Bootloader, LM Flash Programmer

HAllo Leute brauche mal euere Hilfe,

Ich arbeite gerade mit einem Stellaris Chip und will darauf einen 
Bootloader flashen, nun verstehe gerade nicht, mit dem Debugger tu ich 
doch den Bootlaoder, den ich in c code habe, ins Stellaris Flash 
flashen, wozu brauche ich denn genau einen LM Flash Programmer. Meine 
Anwendung habe ich auch als c code, wie flashe ich nun das auf dem 
Stellaris Flash, normalerweise habe ich es vorher auch über den Debugger 
geflasht, wenn ich es wieder machen würde, würde ich doch, den 
Bootloader überschreiben oder? Meine Anwendung ist einfach ein, über den 
Can des Stellaris tu ich daten senden, die dann vom canalyzer empfangen 
werden. Ich verstehe hier jetzt den zusammenhang nicht mehr, wie der 
Bootloader meine Anwendung starten soll. Danke für euere Anregungen.