Doxygen mit DOT nach Files ordnen

Hallo zusammen

Ich habe mittleiweile ein ziemlich grosse Software, mit der ich 
Nachrichten übermitteln kann. Die Software is analog zum OSI-Modell 
aufgebaut, das heisst es gibt im Moment die Layer PHY,MAC und APP.

Mit der Dot-Extension von Doxygen kann ich wunderbar die Hirarchie der 
Calls aufzeichnen lassen. Jedoch wäre es schön, wenn die Funktionen aus 
dem File PHY.c und die Funktionen aus dem File MAC.c jeweils 
untereinander angeordent würden. Gibt es solch eine Einstellung?

                               mac_Funktion A-----
            app_Funktion1-----                     phy_Funktion3
                               mac_Funktion B-----


Etwa so:     APP.c            |     MAC.c         |    PHY.c