Einzelen Pins ein register des Counter zuweisen

Das geht nicht weil PINA1 entweder 1 oder 0 sein kann (1 Bit -> 2^1 = 2 
Zahlen die dargestellt werden können, diese sind eben 0 und 1). Das 
Counter Register besteht zB aus 8 Bit (2^8 = 256 Zahlen, das entspricht 
dem Zahlenbereich von 0 bis 255) Du kannst zB dem gesamten PortA den 
Wert TCNT1 zuweisen und dann einen externen Digital Analog Wandler an 
die Pins hängen. Aber du kannst nicht einen Zahlenwert zwischen 0 und 
255 einem Pin zuweisen der nur die Zahlen 0 und 1 annehmen kann.

Das geht so nicht.

Was würdest Du denn damit erreichen wollen?

Es ist durchaus möglich, einen Pin in Abhängigkeit von Ereignissen des 
Timers zu steuern. Schaue einmal in das Datenblatt unter "Compare unit" 
und "PWM".
Da über Deine Absichten nichts bekannt, und daher schwer zu sagen ist, 
welche Information man Dir geben soll, empfehle ich Dir das Kapitel über 
Timer einmal genau zu lesen.

Okay vielen Dank für die shcnellen Antworten, ich werde mir mal alles 
genau anschauen.

Mit freundlichen Grüßen

Max