SPI und ISP sind Zweierlei...
Da während des ISP-Programmupdates (Flashen, Programmieren) Reset aktiv
ist, sind alle Pins (außer MISO) hochohmig und das im AVR befindliche
Programm kann nicht laufen (weil Reset aktiv ist). Der AVR "hört"
während aktivem Reset also nur auf ISP.
Du solltest allerdings darauf achten, dass deine Peripherie die
ISP-Leitungen nicht dämpft und dass die ISP-Pegeländerungen keine
ungewollten Schalthandlungen an deiner Hardware auslösen.
Mit SPI wird das serielle Peripherie-Interface bezeichnet, eine
Schnittstelle, die das Programm im AVR nutzen kann, um mit
Peripheriebausteinen (wie Schieberegister) kommunizieren zu können.
ISP dagegen ist das Programmieren im System, also in der Zielschaltung,
ohne den AVR auszubauen und in ein spezielles Programmiergerät zu
stecken.
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