Encoder / Hall Drehzahlsignal verarbeitung

Hallo.
Ich habe mal eine Frage an die Regelungstechnik Experten.

Ich habe eine Steuerung mit Regelung für BLDC PSMs.
Als Geber Signal habe ich HALL und ENCODER.

Um die richtige Drehrichtung des Motors zu erhalten, musste ich die 
Phasen U und V tauschen im Bezug zum Motor Datenblatt.
Deshalb habe ich auch das Signal Hall1 und Hall2 vertauscht.
Encoder Signale habe ich mit der Steuerung verbunden wie im Datenblatt 
angegeben, da diese ja nicht an die Phasen gebunden sind wie die Hall 
Sensoren.

Teste ich nun die Regelung, habe ich ein sehr glattes Drehzahlsignal im 
Betrieb mit Hall Sensoren, allerdings den nachteil durch die ungenaue 
Auflösung und daher schlechte d/q-Stromwerte.

Teste ich die Regelung mit Encoder Signal, habe ich einen starken Ripple 
auf der Drehzahl. Eigentlich sollte das Encoder Drehzahlsignal doch 
genauso glatt sein wie das der Hall Sensoren?!

Ist meine Annahme das die Encoder Signale nicht getauscht werden müssen 
wenn U und V getauscht werden richtig?
Oder habe ich einen Denkfehler?

Danke