Bootloader flashen mit Studio atprogram

Guten Tag,
mit google und der Forensuche komme ich leider nicht weiter.
Es gelingt mir nicht, mit der AVR Studio Command Line einen Bootloader 
in einen XMEGA zu brennen.

Ich benutze diesen Aufruf:

atprogram -t avrispmk2 -i pdi -d atxmega64a3u program -f 
c:\temp\xboot.elf


Ergebnis:
The address range [0x10000, 0x110fa> does not fit within memory context 
"prog", ([0x0, 0x11000>) (Error code: 17)

Ja, stimmt, der Bootloader Bereich ist hinter dem "normalen" Flash. Mit 
der GUI bekomme ich auch eine Fehlermeldung, da kann ich aber "OK" 
klicken und es fluppt.

Gibt es einen Parameter beim Aufruf von atprogram um den "Fehler" zu 
ignorieren? Ich finde da nix.

Mit AVRDUDE geht es, aber da ist immer das Theater mit den verschiedenen 
USB Treibern.
Ist das prinzipiell mit atprogram machbar?
Besten Dank,
Gruß
Thomas