PWM und Interrupt

Ja, das geht alles. Du musst die entsprechenden Bits im TIMx 
DMA/Interrupt enable register (TIMx_DIER) setzen. Da kannst beliebig 
zwischen einer Kombination aus den CC Kanälen, dem "update interrupt", 
sowie dem "trigger interrupt" wählen. Wenn du mehrere Quellen nutzen 
willst musst dann in deinem Interrupt Handler nur eine 
Fallunterscheidung einbauen und schauen wo der Interrupt jetzt her kam. 
Entsprechende Informationen gibt dir das Status Register deines Timers.