Embedded C-Code in Matlab einbinden

Im Zuge einer Tool/Compilerumstellung soll geprüft werden ob der C-Code 
(ca. 30 Module) aus 2 unterschiedlichen Quellen gleiche Ergebnisse 
liefert.

Meine erste Idde war die beiden C-Code als MEX-Datei in einer 
Simulink-Testbench einzubinden und zu testen. leider geht das, wie 
immer, nicht so einfach wie es sich anhört...

Meine Frage ist also: Wie kann man Embedded C-Code (Automotive) in 
Matlab einbinden und ausführen, so dass man mit einer Testbench 
sinnvolle Aussagen treffen kann?
Bekannt sind die Benamung der Ein- und Ausgänge, sowie der Parameter und 
die Skalierung der Signale. Was muss man noch wissen um eine C-Testbench 
in Simulink aufzusetzen?