"Projektportierung" ATmega128 -> 32er

Hallo zusammen,

möchte mein compiliertes und funtionierendes GCC - Projekt nach der 
Entwicklung auf einem 128er nun auf einen Mega32 portieren.

Anpassungen musste ich an den UART einstellungen / Registern vornehmen, 
was auch dann gleich funktioniert hat.

Timereinstellungen könnte nun ein Problem sein:
Ich benutze im 128er Timer 1 und Timer 2 für interne warteschleifen.

Timer 1 im 32er besitzt dieselben registereinstellungen und 
bitpositionen wie im 128er... (Ausser TCCR1C fehlt halt)

Timer 0 im 32er ist der selbe wie Timer 2 im 128er... zumindest von den 
registereinstellungen...

also sah ich da auch kein problem das mit bedingter compilierung einfach 
zu ändern... nutze nun Timer 0 im 32er...

aber er(der 32er) tuts noch nicht!

Chip läuft
USART läuft

habe ich noch was übersehen? Registereinstellungen? Timerbits doch 
anders?

Timer laufen beide im CTC Mode. es soll keine PWM erzeugt werden...
ist es "schlimm" wenn beide timer denselben prescaler, aber andere 
einstellungen dafür haben?

was muss ich bei so einer "projektportierung" beachten? Bei AVR studio 
was ändern? außer target chip?

grüße alex