Verständnissfrage zu JTAG, ISP

Peter Gast #2472333
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Hallo!

Ich hab eine Verständnissfrage zur µC Programmierung mit JTAG bzw ISP.
Zum proggen verwende ich den USBProg 4.0 aus dem Shop.

Ich bau gerade ein Schaltung mit Schrittmotoren, die ich über einen µC, 
L297 und L298 steuere. Dem µC sende ich Komandos via RS232 
Schnittstelle.
Weiters hängt auch ein Display dran, Endschalter u.s.w.

Aber nun zur generellen Frage:
Ich möchte den µC nicht immer aus seinem Sockel nehmen, um in zu 
programmieren. (Hab da das Atmel Evaluations Board, wo ich die µCs 
normalerweise beschreibe.)
Wenn ich jetzt daher an meinem µC die Ports PC2 bis PC5 freilasse und 
die Schaltung fürs JTAG dranhänge, kann ich den µC programmieren, obwohl 
die anderen Pins mit dem Display, L297, ect. verbunden sind?

Bzw. was muss ich genau berücksichtigen?

Vielen Dank für eure Hilfe
lg Peter
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