ATMega 32 zu langsam

Hallo

Folgendes Problem: Ich habe meinen Mega32 16MHz (ich takte auch mit 
16Mhz) ausgetauscht weil ein paar Pins an PORT A durch geschossen 
wurden. Der Fehler wurde behoben und der neue Mega32 mit dem alten 
Programm beschrieben dieses läuft auch, aber extrem langsam. Ich 
programmiere mit AVR Dude in C im Makefile sind auch die 16MHz 
deklariert. Die Hardware ist auch nicht defekt denn der alte Prozessor 
funktioniert immer noch (bis auf PORT A).

Nun also, für Tipps währe ich dankbar.