Dateiname grün, lässt sich nicht öffnen

Erklär mal genauer, was du getan hast. Meine Glaskugel färbt sich grau, 
ich kann es nur schemenhaft erraten.
Gesamte Festplatte mit TC verschlüsselt? Vorher war Win drauf, jetzt 
Linux? Wie bzw. mit welchen Mitteln war die externe Platte 
verschlüsselt? Welches Windows?

Du hast vermutlich die betroffenen Ordner mit Windows-Bordmitteln 
verschlüsselt, d.h. in den Ordnereigenschaften unter "Erweitert" das 
Häkchen bei "Inhalte verschlüsseln, um Daten zu schützen" gesetzt. Genau 
dann werden die Ordner im Explorer grün angezeigt. Und nun die schlechte 
Nachricht: Da Windows mit EFS verschlüsselt, lassen sich die Daten nicht 
unter Linux oder sonstwo lesen. Sie sind selbst unter Windows nicht mehr 
lesbar, wenn du nicht vor der Neuinstallation das zugehörige Zertifikat 
gesichert hast. Guckst du auch:

http://board.protecus.de/t21863.htm

grün schrieb:
> ...das heisst also, dass, wenn ich die komplette Festplatte wieder
> entschlüssel, die Datein trotzdem nich öffnen kann???

Ja genau. Die grünen Ordner sind mit EFS verschlüsselt, das hat nichts 
mit Truecrypt zu tun, sondern ist eine windowseigene Funktion. Doppelt 
gemoppelt sozusagen. Für die Entschlüsselung benötigt Windows das 
Zertifikat, welches auch für die Verschlüsselung benutzt wurde. Dieses 
ist aber mit der Neuinstallation verloren gegangen.

grün schrieb:
> oder gibts da vielleicht doch irgendeine Möglichkeit?

Selbst wenn es dir gelänge, die zugehörigen Dateien wiederherzustellen, 
was äußerst unwahrscheinlich ist, wäre das nur die halbe Miete. Dein 
neues Benutzerkonto müßte u.a. exakt die gleiche SID besitzen wie das 
alte. Du müßtest also die alte SID herausfinden und auf den neuen User 
übertragen. DAS wiederum ist aber extremst kompliziert und aufwendig, 
weil die SID auch mit dem System verknüpft ist. Lohnt sich eigentlich 
nur in Fällen mit Bedeutung für die nationale Sicherheit.