STK600 JTAG Ubuntu

Hallo zusammen,

ich versuche gerade den beim STK600 mitgelieferten Mega2560 via JTAG zu 
programmieren unter Ubuntu. In der manpage steht das dies von Avrdude 
nicht supported wird! Gibt es da evtl. einen Workaround?
Vielen Dank schonmal im Vorraus

MFG

Smartwing