avrone.exe v1.1.1 brennt ATXMega256A3B Bootloader nicht korrekt

Hallo zusammen, Hallo Jörg!

So ein Ärger kurz vor dem Wochenende: Wir haben einen neuen Atmel AVR 
JTAG-Programmer gekauft, den AVRONE!. Jetzt sollte er zuerst innerhalb 
diverser Makefiles den bisherigen JTAGICEMKII ersetzten. Die avrone.exe 
aus dem AVRSTudio 4.19.684 scheint in den Parametern kompatibel mit 
denen der jtagicemkii.exe zu sein. Es scheint auch alles zu 
funktionieren. Nur das Hexfile des Bootloader (ab 0x40000) wird falsch 
gebrannt. Wen ich es mit den selben Parametern mit der jtagicemkii.exe 
brenne, funktioniert der XMEGA, mit dem avrone.exe nicht. Ein Auslesen 
des Flashs nach dem Brennen und Vergleichen des Inhalts zeigte, dass der 
avrone die Daten von 2 Bereichen vertauscht hat - das sieht wie ein Bug 
im AVRONE aus. Über das GUI von AVRSTudio 4.19.684 und Atmel Studio 6.1 
funktioniert es problemlos.

Und übrigens: Leider scheint auch mit dem neuesten Studio und dem teuren 
AVRONE kein Stacktrace zu funktionieren.

Meine Fragen:
- Ist meine Version von avrone.exe die neueste verfügbare? Wenn nicht, 
wo gibts eine neuere Version?
- gibt es ein anderes Kommandozeilentool für den AVRONE! AVRDUDE und 
Linux wäre auch sehr interessant.
- hat jemand von Euch schon mal einen Bootloader mit dem AVRONE 
gebrannt?
- wo / wie kann man von Atmel am schnellsten Hilfe/Bugfixes zu dem Thema 
bekommen?

Vielen Dank Euch allen und ein schönes Wochenende!
Gruß Marcel