Zählerprogramm am Inkrementalgeber

Hallo Zusammen,
ich habe hier einen Inkrementalgeber des Typs HEDS 9100. Dieser hat eine 
Scheibe eingebaut mit 500 streifen. Jetzt dachte ich mir könnte ich die 
Drehzahl des Motors anhand dieses Inkrementalgebers anzeigen lassen.
Um zu testen ob der microcontroller die vielen tausend Impulse des 
Inkrementalgebers verarbeitet hate ich diesen kurzerhand an den 
Microcontroller angeschlossen. VCC liegt auf +5V, Ground auf Ground und 
die beiden Kanäle an 2 Ports welche als Eingänge definiert wurden. Jetzt 
sollte mein Programm zählen (bis 5000 ca) und eine LED zum leuchten 
bringen wenn diese Zahl erreicht wird. Mein Programm sieht so aus:

1

#include <avr/io.h>      

2

3

4

5

int main(void){    

6

7

  uint8_t counter = 0;  //Zaehlvariable

8

9

  DDRD = 0x00;    //Alle PINs als Eingang definieren

10

  DDRA = 0xff;    //Alle Pins als Ausgang definieren

11

12

    while(1)      //Endlosschleife

13

    {

14

    if( PIND & (1<<PD2))  //Falls ein Signal an PortD 1 

15

    {

16

    counter++;    //counter um 1 inkrementieren

17

                }

18

    if(counter >= 5000)

19

    {

20

      PORTA |= 1<<PA2;

21

    }

22

        }

Ich probiere schon mit beiden Kanälen herum , komme aber leider zu 
keiner funtkionstüchtigen Lösung. Vielleicht sieht ja einer von euch was 
für Fehler hier vorhanden sind.

Gruß