atmega 2560 und Studio 4 läuft nicht

Liebe Alle,

ich versuch mit Studio 4.18 einen arduino mega 2560 zu programmieren.
Was funktioniert:
flashen, flash verifizieren, fusebits auslesen, 16Mhz läuft auch.
was einfach nicht funktioniert ist das er das programm abarbeitet.
hatte auch schon ein anderes board mit atmega 2560 dran. selbe problem.
sobald ich einmal flashe ist das arduino auslieferungsprogramm platt und 
es tut sich einfach nichts. Fash ich das arduino programm wieder drauf 
geht das auch nicht mehr.
fashe ich hingegen einen mega32 oder 644 oder 328 läuft alles wie 
gewohn.
in den projektsettings stell ich nur den richtigen uC ein und 
taktfequenz.
gefashen wird mit einem STK500.
für mich siehts so aus als würde der uC nicht richtig einspringen und 
irgendwo im nirvana herum hängen. aber damit kenn ich mich gar nicht aus 
wo ich da nachschaun könnte oder sowas. programmiere mit dem gcc 
20100110

herzlichsten dank für jeden hinweiss!