Raspberry PI einlesen von Dateien in eclipse

Moin,

ich kompiliere cross unter windows für den Raspberry PI und nutze die 
GNU toolchain.

Ich habe das Problem, dass sämtliche Dateioperationen nicht ausgeführt 
werden können während ich debugge. Angegebene Dateipfade können nicht 
gefunden werden.

Wenn ich mir im Programm den Inhalt des aktuelles Ordners auflisten 
lasse erhalte ich folgendes. Daraus schließe ich, dass ich gar nicht mit 
der Dateistruktur von linux arbeite? Wo wird mein programm ausgeführt? 
Nach dem debugging, befindet sich das Programm auf dem Raspberry unter 
dem gewünscten Pfad und kann normal ausgeführt werden. Es ist jedoch 
zeit raubend, zum debuggen immer die Konsole aufrufen zu müssen.

1

.Xauthority

2

.minecraft

3

libmodbus

4

Music

5

.pki

6

Videos

7

mu_code

8

.gnupg

9

.bluej

10

.vnc

11

.xsession-errors.old

12

Public

13

Downloads

14

datenbank.db

15

.local

16

.

17

.bash_logout

18

Pictures

19

MagPi

20

.bashrc

21

Documents

22

Desktop

23

.bash_history

24

db.db

25

..

26

eclipse

27

.profile

28

config.sh

29

.mozilla

30

Templates

31

.thumbnails

32

.cache

33

.config

34

adapter

35

.java

36

.xsession-errors