Problem: Debuggen mit JTAG-Adapter

Hallo!

Beim Debuggen mit einem JTAG-Adapter (JTAG-Ice mkII und Olimex 
AVR-JTAG-USB) bleibt der Debugger an gewissen Stellen hängen. Die Led 
des Adapters blinkt noch, aber das Programm läuft nicht weiter. Der 
gelbe Pfeil verschwindet auch nach einigen Sekunden.
Dann hilft nur noch ein Reset.
Das Programm läuft auf einem AtmegaEvoBoard mit dem AT90CAN128.

Kennt vielleicht jemand dieses Problem und kann Tipps geben was man 
machen kann?

Danke im Voraus für eure Hilfe!