IC (FPGA) mit mehreren Betriebsspannungen - eine 0V - Messung OK?

Konkret kommt bei der Inbetriebnahme und im Service immer mal wieder ein 
Gerät bei dem ein Spannungswandler defekt ist (0V am Ausgang) die 
anderen dagegen OK sind. Das führt dazu das bei einigen IC's eine 
Spannung (z.B Xilinx-FPGA Vccaux = 2V5) fehlt während die anderen 
(Corespannung 1V8, Vio 3V3 anliegen).

Ganz allgemein gefragt, kann es und falls ja unterwelchen Bedingungen in 
einem solchen Fall zu Beschädigungen kommen. Ich dachte dabei an 
Messungen von 1 - 15 Minuten dauer unter (Niedrig-) Spannung für die 
Fehleranalyse.

MfG