Wenn du zwei Netzteile hast, musst Du den Minus der beider Netzteile
erden oder zumindest verbinden, damit Du Spannungen richtig messen
kannst.
Anderfalls musst Du Übertrager oder Optokoppler nehmen.
In Deinem Fall würde ich einfach die Massen (Minus) miteinander
verbinden.
Du darfst halt nur nicht irgendwo + und - verbinden, dann gibts einen
Kurzschluss und der könnte dir Deinen PC zerstören.
Deine Platine würde ich nicht über USB versorgen, da hier die
Stromabgabe vom USB Port begrenzt ist. Mehr als 100mA sind nicht
erlaubt, bis 500mA nur nach Freigabe vom USB-Controller.