OVERFLOW Zeitmessung

Guten Tag Jungs

hab mal wider ein Problem und zwar, ich möchte gerne die Dauer eins 
OVERFLOW messen. dafür schalte ich am Beginn des Interrupt der Ausgang 
PC3 AUF HIGH und am ende wider auf Low mein Ozi zeigt eine zeit von 
40ms, bis dann wider der Ausgang auf high umschaltet dauert aber 3.32 s 
bzw ich habe eine Periodendauer von über 3 sekunden obwohl die 
Interrputrotine soll jede sekunde ausgelöst werden!!!!???warum dauert es 
so lang?

Meine kentnisse in dem Bereich sind echt minimal und allein komm ich 
leider nicht weiter, wäre dankbar, wenn jemnad mir helfen kann.

Danke im Vcoraus

Carlos