Altera Cyclone III im QFP240 Gehäuse, Pins-Kompatibilität

Eigentlich macht man es so, dass man diese PINs garnicht nutzt. Musst du 
dort V draufschalten? Wofür? sind diese Spannungen nicht genau für die 
Pins, die Du aufgrund der Maskkierung durch die kleinen FPGAs gar nicht 
nutzen kanns?

Kommt mir seltsam vor.

Laut Datenblatt von Altera werden diese Pins, je nach FPGA-Größe, als 
I/O oder als Spannungsversorgungspins benutzt.

Du schließt an die Pins die Versorgungsspannung an, wie für das große 
FPGA benötigt. Bei den kleinen FPGAs musst du nur darauf achten das die 
Pins als Input/Tristate geschaltet sind

In den Projekteinstellungen die Migration-Devices auswählen und fertig.