Atmel128 ISP

Das ISP-Protokoll mit dem ein ATMEGA128 (den meinst du doch??) 
programmiert wird,ist im Datenblatt selbigens recht gut erklärt.Die 
Infos darin sollten ausreichen um das zu implementieren.Von der 
Hardwareseite her ist es nix anderes als ein SPI-Interface mit einem 
Low-Pegel am RESET-Pin des ATMega128.Das Kapitel "Memory Programming" im 
Datenblatt erklärt,wie genau das funktioniert.

Auf dem STK500 z.B wird es genauso gemacht,ein AVR (ATMEGA8535L) 
programmiert einen anderen AVR.Dazu lädt dieser über die serielle 
Schnittstelle das Programm vom PC (z.B über AVR-Studio) und taktet das 
seriell in den Zielprozessor.(Falls dieser das unterstützt.Ansonsten 
gibt es beim STK500 noch parallele und HV-Programmiermodi,aber das ist 
ein anderes Thema)

Das STK500 unterstützt ohne Zusatzhardware nur gesockelte 
Prozessoren,die Schaltung und die Software zum Programmieren eines 
ATMega128 unterscheidet sich jedoch nicht wesentlich.

Zu den verschiedenen Protokollen gibt es etliche Application Notes bei 
ATMEL.Da sollte auf jedenfall was brauchbares dabei sein.