clock mit dem timer erzeugen

Jetzt muss man sich schon die nötigen Infos aus dem Posting und dem 
Nick zusammensuchen...

Also, da Du offensichtlich in Sachen AVR unterwegs bist: Im Prinzip geht 
das, wenn das "in dem Moment" nicht auf die µs genau sein muss.

> Wie sollte man da vorgehen? in der ISR die lese Funktion aufrufen?
Das wäre die reproduzierbarste Variante. Allerdings vergeht (wie oben 
bereits angedeutet) eine gewisse Zeit vom Auftreten des Interrupt bis 
zur Ausführung des Codes in der ISR.