STM32 Zeitmessung mit den Timer

Hallo,

ich möchte Laufzeiten von Programmcode mit den Timer messen.
Dazu habe ich den Timer5 genommen, lasse diesen frei laufen, setze dann 
einmal das CNT Register zurück, führe meinen Code aus und frage CNT 
anschliessend wieder ab.

Die Timer-Einstellung passt soweit. Kontrolliert habe ich das durch das 
Toggeln einer LED, welche jede Sekunde ihren Zustand wechselt.
(Timer zählt bis 100 Millionen).

Die Laufzeitmessung passt allerdings vorne und hinten nicht. Die 
Laufzeiten sind viel zu hoch. Ich messe beim Debugging zwischen zwei 
Codezeilen zufällige Werte zwischen 0,3 - 0,8 Sekunden. Debuggen lässt 
sich das auch nicht richtig. Zwischen StartTiming() und StopTiming() 
fliegt der Debugger in die ISR Routine. Wenn ich die Haltepunkte nur 
ganz am Ende setze bei zeit = ReturnTiming() habe ich dennoch viel zu 
hohe Werte.

Das CNT Register ist lt. Reference "rw".

Hier die main

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uint32_t Zeitspanne = 0;

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//main

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uint32_t zeit = 0;

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  Timer5Init();                         

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  StartTiming();

8

  for(int i = 0 ; i< 1000;i++)

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  {}

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  StopTiming();

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  zeit = ReturnTiming();

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//Funktionen

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void Timer5Init()

16

{

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TIM5_PSC     = 0;                                      

18

TIM5_ARR     = 100000000 ;                        

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TIM5_DIER   |= 1;                                      

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TIM5_CR1    |= 1;                                      

21

}

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void StartTiming()

25

{  

26

TIM5_CNT = 0x00000000;                                

27

}

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void StopTiming()

30

{

31

zeitspanne = TIM5_CNT;                               

32

}

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uint32_t ReturnTiming()

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{

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return (zeitspanne/100);     //Rückgabe der Zeit in µs

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}

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//IR

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void TIM5_IRQHandler(void)

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{

43

  TIM5_SR = 0x0; 

44

  GPIOE_BRRS = (GPIOE_ODR ^ 0x8000) | (0x8000 << 16); //LED toggeln

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}