CubeMX Update For Schleife plötzlich infinite loop?

Komisch vorher hats mit "<8" immer nur 7 Zeilen angezeigt. Jetzt läuft 
es so wie es eigentlich soll. Fragt mich trotzdem was das mit dem CubeMX 
Update zu tun haben soll.

Was aber auch nicht passt ist, dass ich in der While Schleife vom 
mainloop eine der beiden Zeilen drin stehen haben muss, sonst macht der 
Controller nichts oder die Anzeige macht nur nichts:

1

HAL_Delay(1);

2

HAL_GPIO_TogglePin(GPIOC, GPIO_PIN_13);

Kommentiere ich beide Zeilen aus funktioniert es nicht mehr.
An dem Port hängt lediglich eine LED.

Mit Timing hat es nichts zu tun. Steht noch einiges mehr in der 
mainloop.

Wenn ich eine Abfrage einrichte, dass die LED nach 5 Tagen eingeschalten 
wird reicht das aus. Hauptsache es steht irgendwo in der mainloop, sonst 
bleibt das Display schwarz.

Wenn ich die Zeilen wo das Display gelöscht wird auskommentiere, dann 
bleibt der Display Inhalt von vorher. Demzufolge funktioniert die 
Initialisierung des µC, aber irgendwo danach bleibt er hängen wenn der 
GPIO Port nicht geschalten wird.

Das heißt der µC erwartet:
HAL_GPIO_TogglePin(GPIOC, GPIO_PIN_13);
oder
HAL_Delay(1);
irgendwo in der mainloop

Dabei ist es egal ob der Fall eintreten kann. Wenn ich den Timer vor 
Ablauf der 5 Tage zurücksetze, kann der Fall nie eintreten, dass der 
GPIO Port geschalten wird.

Auch egal ist welcher Port. Selbst nicht initialisierte Ports sind egal.


Off Topic:
Der Code ist aus der Initialisierung. Ich verwende dort kein DMA damit 
ich keine Abfrage einbauen muss ob der DMA COntroller fertig ist, 
sondern die Initialisierung schön der Reihe nach abläuft. Danach alles 
mit DMA.