externe Speisung eines Arduino Leonardo

Hallo,
ich möchte gern mit einem Arduino (z.B. Leonardo) Spannungen messen, 
aber ihn nicht über USB, sondern separat versorgen. Ich habe dazu einen 
5-V-Spannungsregler eingebaut und gebe dessen Ausgangsspannung auf den 
VIN-Pin.
Dann entnehme ich die anderswo benötigten 5 V am 5-V-Pin (es hängt 
nichts weiter dran als ein EEPROM). Leider liegen an diesem 5-V-Pin aber 
keine 5 V an (wie bei USB-Versorgung), sondern nur 4,03 V.

Dem EEPROM macht das nichts, aber wie ist das mit der Referenzspannung 
für die Spannungsmessung? Nur noch 4,03 V ? Stört eigentlich nicht, kann 
mit einem Korrekturfaktor behoben werden, aber eigenartig ist es schon.

Problematischer bei meiner externen Versorgung über den VIN-Pin ist, daß 
das Programm nur läuft, wenn ich die externe Versorgung eingeschaltet 
habe und dann den USB-Anschluß, der vom Programmieren her noch vorhanden 
war, abziehe. Dann läuft das gestartete Programm weiter. So wie man das 
benötigt, nämlich den programmierten Arduino extern mit Strom versorgen, 
auf Reset drücken und fertig - das geht leider nicht.

Ist das mit der externen Stromversorgung doch nicht so einfach, wie ich 
mir das gedacht habe?

VG
735knut