AVRStudio Debugger Problem

Hallo

ich habe ein kleiner Projekt im AVR Studio erstellt. Wenn ich nun 
Debuggen möchte handelt der Debugger für mich etwas unverständlich.

In dem Projekt lade ich zu beginn die ganzen notwendigen Inits.


//Controller initiieren
void Initialize(void)
{
  cli();          // Interrupts sperren

  TargetInitialize();    //Target(Ports/Pin) Init
  TimerInitialize();    //Timer Init

  if(RS232)
  {
    InitUART();    //UartInit
  }


  sei();        //Interrupts aktivieren
}


Hauptprogramm:

int main(void)
{

  //Alle Komponenten initalisieren
  Initialize();

  RS232_OUT(TransmitString("Hauptschleife\r\n\n"));

while(1)                   // Main Loop
  {



Nun zum Problem. Wenn ich mit dem Debugger losgehe, fängt dieser mit der 
Fkt Initalize() an. Doch mitten in der kunktion springt er dann ins 
Hauptprogramm und macht da kurz weiter. Dann erfolgt wieder der Sprung 
zurück in die Initalize. ich hätte ja gedacht, das man nach und nach die 
weiteren Fkt. in Initalize() abarbeitet. Also 1. TargetInit und dann 2. 
Timerinit usw.

Hat jemand eine Idee?

Danke