Atxmega128a1 - Drehgeber auslesen

Hey Leute..Zuerst muss ich sagen dass ich relativ neu bin im Umgang mit 
µCs..Hab nen bischen mit Arduino gebastelt und bin jetzt auf die Atxmega 
umgestiegen. Benutze den Atxmega 128a1 mit der IDE Atmel Studio v7 
müsste das sein. Das Programm dient grundsätzlich dazu einen Drehgeber 
auszulesen. Dazu soll er mir erstmal die zurückgelegten Inkremente 
ausgeben.

Stand: Alles initialisiert. UART funktioniert. Interrupt wird ausgelöst.

Probleme: Einerseits gibt er in HTerm teilweise vierecke zwischendurch 
aus. Woran liegt das?

Das größte Problem ist jedoch folgendes: Nachdem er in die ISR springt 
und dort ein Inkrement in die jeweilige Richtung hochzählt, gibt er 
keinen weiteren Wert aus. Er stoppt sozusagen, nachdem er das Interrupt 
durchlaufen hat anstatt an die vorherige Stelle in der Main 
zurückzuspringen. Fehlt mir dazu noch ein Befehl im Code um 
zurückzuspringen? Er stoppt selbst die serielle Ausgabe. Als ob er in 
die main nicht mehr rein springt.. Zudem gibt er mir am Ende auch nicht 
den hochgezählten Wert aus.

Beim debuggen ist zu erkennen, dass er das Interrupt richtig abarbeitet. 
Jedoch nachdem er aus dem Interrupt geht, springt er in den 
"Disassembly" in die Stellen 127 bis 129 und verbleibt dort im "no 
source file" (fängt nach 129 wieder bei 127 an)..

Packe den Code in einer TXT datei, einen Screenshot von HTerm  sowie des 
Disassembly in den Anhang.

Kann mir da jemand helfen?

Grüße Bryan